53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0086 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  100 
 
 
166 aa  322  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.61 
 
 
163 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  60.61 
 
 
198 aa  177  6e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  60.45 
 
 
157 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  58.96 
 
 
167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  58.96 
 
 
180 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  53.29 
 
 
166 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  52.12 
 
 
196 aa  172  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  62.41 
 
 
180 aa  170  7e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  52.63 
 
 
166 aa  170  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  60.9 
 
 
164 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  60.9 
 
 
164 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  60.9 
 
 
164 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  56.94 
 
 
164 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  54.11 
 
 
167 aa  167  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  60.15 
 
 
183 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  56.39 
 
 
176 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  52.5 
 
 
167 aa  165  3e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  58.65 
 
 
164 aa  162  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  55.07 
 
 
159 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  50.34 
 
 
159 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  49.66 
 
 
159 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50.34 
 
 
160 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  53.62 
 
 
159 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  56.49 
 
 
158 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  51.13 
 
 
162 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.3 
 
 
157 aa  130  8e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.66 
 
 
160 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  40.68 
 
 
159 aa  80.5  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  34.29 
 
 
158 aa  75.9  2e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  32.58 
 
 
193 aa  70.5  1e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  29.05 
 
 
167 aa  67.8  7e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  27.2 
 
 
161 aa  66.6  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  32.58 
 
 
160 aa  63.5  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  30.23 
 
 
160 aa  62.8  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  27.27 
 
 
165 aa  62  4e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.91 
 
 
172 aa  60.8  7e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.38 
 
 
155 aa  56.6  2e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  27.21 
 
 
167 aa  55.1  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  27.21 
 
 
167 aa  55.1  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  30.51 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  31.11 
 
 
165 aa  53.1  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  30.71 
 
 
165 aa  52  4e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  24.19 
 
 
164 aa  51.2  6e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  1.72849e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  26.98 
 
 
153 aa  50.8  8e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.27775e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  24.19 
 
 
151 aa  50.4  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  27.52 
 
 
136 aa  50.4  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25340  hypothetical protein  25.53 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>