More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0078 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63.8 
 
 
586 aa  715  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  100 
 
 
643 aa  1233  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  51.93 
 
 
594 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  51.75 
 
 
606 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  52.88 
 
 
601 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  52.64 
 
 
650 aa  577  1e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  52.23 
 
 
616 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  51.95 
 
 
594 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  51.86 
 
 
611 aa  558  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.28 
 
 
616 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0973  ABC transporter related  52.76 
 
 
600 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0888  ABC transporter related  52.61 
 
 
600 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.77 
 
 
627 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.9 
 
 
597 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.03 
 
 
632 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1279  ABC transporter-related protein  53.47 
 
 
612 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173874  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.7 
 
 
641 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.57 
 
 
639 aa  508  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
619 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.73 
 
 
629 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  47.15 
 
 
634 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  48.01 
 
 
600 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  47.28 
 
 
600 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.38 
 
 
628 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.91 
 
 
600 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.57 
 
 
601 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.29 
 
 
614 aa  495  1e-138  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.22 
 
 
597 aa  492  1e-138  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.89 
 
 
595 aa  492  1e-138  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3324  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.02 
 
 
680 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.62 
 
 
613 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.86 
 
 
593 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.45 
 
 
622 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.31 
 
 
613 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  44.53 
 
 
595 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.9 
 
 
597 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.8 
 
 
608 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.3 
 
 
618 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.25 
 
 
617 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.05 
 
 
620 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  43.04 
 
 
586 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.46 
 
 
637 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  42.72 
 
 
586 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.11 
 
 
605 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.66 
 
 
634 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.07 
 
 
580 aa  469  1e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.34 
 
 
634 aa  470  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.54 
 
 
608 aa  469  1e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.19 
 
 
644 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  48.66 
 
 
618 aa  471  1e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.57 
 
 
644 aa  470  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.66 
 
 
618 aa  471  1e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.13 
 
 
603 aa  466  1e-130  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.42 
 
 
613 aa  467  1e-130  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.81 
 
 
598 aa  467  1e-130  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.99 
 
 
616 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.79 
 
 
582 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  48.65 
 
 
578 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.77 
 
 
606 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.65 
 
 
619 aa  461  1e-128  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.9 
 
 
625 aa  460  1e-128  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.53 
 
 
586 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.85 
 
 
589 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.81 
 
 
595 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  43.74 
 
 
586 aa  454  1e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.54 
 
 
589 aa  455  1e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  48.12 
 
 
600 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.98 
 
 
587 aa  446  1e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  47.1 
 
 
602 aa  446  1e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.56 
 
 
590 aa  447  1e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.97 
 
 
590 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  43.33 
 
 
593 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.24 
 
 
631 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.45 
 
 
605 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.69 
 
 
568 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.46 
 
 
587 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  45.1 
 
 
597 aa  439  1e-122  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.36 
 
 
587 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.55 
 
 
592 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.03 
 
 
605 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.83 
 
 
597 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  42.31 
 
 
589 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.18 
 
 
606 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.49 
 
 
608 aa  429  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  43.49 
 
 
599 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  43.17 
 
 
681 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
598 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  45.24 
 
 
588 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.84 
 
 
600 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.15 
 
 
601 aa  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.82 
 
 
589 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.79 
 
 
598 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
623 aa  408  1e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4256  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  45.32 
 
 
588 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.84 
 
 
601 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  37.26 
 
 
603 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  37.04 
 
 
597 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  33.33 
 
 
568 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
601 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.83 
 
 
594 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>