59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0077 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  100 
 
 
298 aa  563  1e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  58.24 
 
 
306 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  54.79 
 
 
298 aa  291  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  55.21 
 
 
279 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  52 
 
 
283 aa  254  1e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  43.43 
 
 
279 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  53.69 
 
 
337 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  58.37 
 
 
303 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  53.31 
 
 
290 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  43.96 
 
 
279 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  44.72 
 
 
311 aa  244  1e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  47.08 
 
 
304 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  44.44 
 
 
302 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  44.09 
 
 
302 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  44.32 
 
 
282 aa  239  6e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  45.36 
 
 
295 aa  238  7e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  46.79 
 
 
295 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  40.57 
 
 
292 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  45.31 
 
 
309 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  46.12 
 
 
306 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  44.49 
 
 
315 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  43.92 
 
 
315 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  44.53 
 
 
315 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  40.28 
 
 
291 aa  226  5e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  45.04 
 
 
309 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  40 
 
 
284 aa  222  5e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  43.75 
 
 
288 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  39.35 
 
 
281 aa  215  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  40.43 
 
 
282 aa  213  3e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  48.46 
 
 
375 aa  213  3e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  48.46 
 
 
326 aa  213  4e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  44.3 
 
 
281 aa  212  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  37.17 
 
 
317 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  38.62 
 
 
282 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.83031e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  38.21 
 
 
282 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  40.08 
 
 
302 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  37.4 
 
 
282 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  41.84 
 
 
272 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.50691e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  44.68 
 
 
270 aa  201  1e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  37.25 
 
 
275 aa  197  2e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  40 
 
 
266 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  38.35 
 
 
279 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  34.27 
 
 
312 aa  192  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  36.9 
 
 
272 aa  191  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  46.61 
 
 
282 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  39.24 
 
 
271 aa  184  2e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  34.9 
 
 
269 aa  180  3e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  35.32 
 
 
275 aa  163  4e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  31.19 
 
 
847 aa  58.5  1e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  26.09 
 
 
306 aa  56.6  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  31.97 
 
 
412 aa  54.7  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  40.79 
 
 
831 aa  51.6  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
437 aa  51.2  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  32.46 
 
 
437 aa  50.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  35.54 
 
 
455 aa  50.4  3e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  31.58 
 
 
437 aa  50.8  3e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  34.81 
 
 
845 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  28.24 
 
 
847 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  40.23 
 
 
815 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>