More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0068 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
318 aa  640  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
316 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
316 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
342 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 
316 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
317 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
316 aa  198  1e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
319 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
320 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
320 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  38.34 
 
 
329 aa  190  3e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
316 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  36.31 
 
 
316 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
317 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
310 aa  180  3e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
305 aa  179  6e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
329 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
329 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
300 aa  175  1e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
300 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
309 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
300 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
338 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 
311 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
306 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
306 aa  152  6e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
303 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.72 
 
 
298 aa  141  1e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.63 
 
 
298 aa  139  5e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 
298 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
318 aa  137  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
311 aa  135  1e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
306 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
332 aa  132  7e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 
302 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
307 aa  129  4e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
306 aa  129  5e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
315 aa  129  7e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 
306 aa  128  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.388332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  128  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
302 aa  127  2e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 
301 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.82 
 
 
302 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 
302 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 
296 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
306 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
310 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
315 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
299 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
306 aa  117  2e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 
300 aa  117  2e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 
300 aa  117  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
300 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
300 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 
300 aa  116  4e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
306 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
306 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
300 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
302 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
300 aa  115  9e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
300 aa  115  9e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 
300 aa  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  8.08392e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
326 aa  115  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
312 aa  114  2e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
305 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
351 aa  112  8e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4296  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
295 aa  111  2e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 
312 aa  110  2e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 
302 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
317 aa  109  7e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 
302 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
311 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
302 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0445545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>