57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0067 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  714  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  65.65 
 
 
367 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  65.64 
 
 
363 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  60.23 
 
 
371 aa  417  1e-115  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  60.8 
 
 
371 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  61.93 
 
 
372 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  38.66 
 
 
361 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  38.95 
 
 
361 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  38.95 
 
 
361 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  40.06 
 
 
375 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  39.5 
 
 
375 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  35.24 
 
 
357 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  34.76 
 
 
367 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  35.62 
 
 
650 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  32.41 
 
 
632 aa  84.7  2e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  32.41 
 
 
632 aa  85.1  2e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  29.27 
 
 
379 aa  76.6  6e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  32.37 
 
 
369 aa  72.4  1e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  27.19 
 
 
367 aa  69.7  8e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  27.39 
 
 
375 aa  69.3  1e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  34.12 
 
 
534 aa  68.9  1e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.87 
 
 
691 aa  67.8  3e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  34.42 
 
 
609 aa  66.2  8e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  36.51 
 
 
552 aa  66.2  8e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  37.04 
 
 
680 aa  61.6  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.3 
 
 
746 aa  60.1  6e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  27.41 
 
 
376 aa  57.8  3e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  36.04 
 
 
450 aa  56.2  8e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  25.73 
 
 
351 aa  55.8  1e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  31.21 
 
 
631 aa  55.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  26.37 
 
 
363 aa  54.7  3e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  23.75 
 
 
358 aa  54.3  3e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  30.83 
 
 
638 aa  54.3  3e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  27.3 
 
 
352 aa  52  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  31.33 
 
 
700 aa  50.4  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  33.06 
 
 
372 aa  50.1  6e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.11 
 
 
706 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.11 
 
 
706 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.11 
 
 
706 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30 
 
 
695 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30 
 
 
695 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  30 
 
 
695 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  30 
 
 
695 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.79 
 
 
719 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.28 
 
 
699 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.55 
 
 
651 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.55 
 
 
651 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.29 
 
 
695 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  32.03 
 
 
717 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.06 
 
 
695 aa  46.2  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30 
 
 
657 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.85 
 
 
696 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  32.03 
 
 
717 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  35.56 
 
 
647 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35 
 
 
746 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.19 
 
 
660 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.48 
 
 
733 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>