34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0057 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0057  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  363  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1321  hypothetical protein  61.78 
 
 
259 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5109  hypothetical protein  62.89 
 
 
194 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2133  hypothetical protein  58.85 
 
 
192 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3573  hypothetical protein  60.71 
 
 
196 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0597766  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1304  hypothetical protein  73.85 
 
 
241 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3947  hypothetical protein  61.22 
 
 
196 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180618  normal  0.604818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5307  hypothetical protein  61.22 
 
 
196 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3488  hypothetical protein  60.71 
 
 
196 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00401228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2125  hypothetical protein  57 
 
 
200 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2546  hypothetical protein  61.17 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3678  hypothetical protein  58.15 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5539  hypothetical protein  56.19 
 
 
194 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642633  normal  0.0183709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5721  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277173  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0044  hypothetical protein  74.02 
 
 
278 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1544  hypothetical protein  74.02 
 
 
191 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1456  hypothetical protein  74.02 
 
 
191 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1751  hypothetical protein  57.73 
 
 
194 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3738  hypothetical protein  71.43 
 
 
199 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3695  hypothetical protein  67.86 
 
 
212 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.841303  normal  0.591313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0498  hypothetical protein  67.86 
 
 
212 aa  158  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  58.14 
 
 
210 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1231  hypothetical protein  60.15 
 
 
199 aa  154  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0559905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  51.11 
 
 
320 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003557  hypothetical protein  52 
 
 
210 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000457432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02518  hypothetical protein  51.2 
 
 
210 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0989  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  131  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0344  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3034  hypothetical protein  50.89 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3132  hypothetical protein  50 
 
 
271 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3233  hypothetical protein  50 
 
 
271 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0150  hypothetical protein  48.91 
 
 
238 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2053  hypothetical protein  47.41 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0738137  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2808  hypothetical protein  38.5 
 
 
186 aa  111  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>