60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0056 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
448 aa  902  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  55.71 
 
 
504 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  56.58 
 
 
461 aa  478  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  51.12 
 
 
507 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  63.81 
 
 
509 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  34.93 
 
 
418 aa  255  1e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  2.36385e-07  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  36.9 
 
 
418 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  34.17 
 
 
439 aa  233  4e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  34.24 
 
 
415 aa  214  3e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  43.48 
 
 
527 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  49.7 
 
 
474 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  49.11 
 
 
240 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  7.87089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  29.25 
 
 
426 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.71 
 
 
507 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  27.32 
 
 
478 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.71 
 
 
501 aa  86.3  1e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  27.11 
 
 
421 aa  84.7  3e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  84.3  4e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.09 
 
 
275 aa  84.3  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.91 
 
 
496 aa  84  5e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.1 
 
 
483 aa  83.6  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  27.3 
 
 
508 aa  84  6e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.1 
 
 
483 aa  83.6  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  31.1 
 
 
477 aa  83.6  7e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  31.1 
 
 
564 aa  82.8  1e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  82.8  1e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  31.1 
 
 
472 aa  82.4  1e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  82.8  1e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  27.34 
 
 
381 aa  81.6  3e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  29.29 
 
 
480 aa  80.9  5e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30.49 
 
 
440 aa  79  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  30.06 
 
 
308 aa  79  2e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  26.67 
 
 
253 aa  71.6  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  28.66 
 
 
264 aa  70.5  6e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  26.33 
 
 
253 aa  69.7  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  26 
 
 
253 aa  67.8  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  24 
 
 
249 aa  62  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28.74 
 
 
412 aa  55.1  2e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  31.15 
 
 
251 aa  55.5  2e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  27.68 
 
 
260 aa  53.1  9e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  27.27 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  23.76 
 
 
787 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  23.76 
 
 
842 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  32.53 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  32.08 
 
 
239 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  37.1 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26 
 
 
272 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  31.46 
 
 
249 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  24.04 
 
 
195 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  34 
 
 
276 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  30.77 
 
 
263 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  42.22 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  33.68 
 
 
275 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  43.48 
 
 
254 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 
259 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  42.22 
 
 
246 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>