162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0053 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  83.51 
 
 
376 aa  668  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  100 
 
 
397 aa  823  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  63.07 
 
 
395 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  63.07 
 
 
395 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  62.81 
 
 
399 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  62.97 
 
 
398 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  59.7 
 
 
394 aa  491  1e-138  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  58.15 
 
 
393 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  55.39 
 
 
394 aa  453  1e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  42.68 
 
 
424 aa  312  6e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  41.06 
 
 
399 aa  312  7e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  41.67 
 
 
411 aa  303  5e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  42 
 
 
405 aa  292  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  37.73 
 
 
430 aa  256  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  36.52 
 
 
416 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.35 
 
 
412 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.08 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.24 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  22.2 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  22.2 
 
 
448 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.69 
 
 
386 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.25 
 
 
395 aa  86.3  1e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.74 
 
 
390 aa  80.1  6e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.74 
 
 
390 aa  80.1  6e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25.98 
 
 
369 aa  79.3  1e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  21.91 
 
 
369 aa  79  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.27 
 
 
378 aa  78.2  2e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.81 
 
 
376 aa  77.8  3e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.99 
 
 
390 aa  77.4  4e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.92 
 
 
378 aa  76.3  1e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  24.11 
 
 
427 aa  75.5  1e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35453e-05 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.33 
 
 
398 aa  76.3  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  21.29 
 
 
377 aa  74.3  4e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.13 
 
 
382 aa  73.6  5e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.94 
 
 
397 aa  73.6  7e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  20.94 
 
 
382 aa  72.8  9e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  20.94 
 
 
382 aa  72.8  9e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  24.66 
 
 
386 aa  72.4  1e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.02 
 
 
370 aa  72.8  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  23.71 
 
 
409 aa  72  2e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  24.46 
 
 
388 aa  71.6  2e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  22.93 
 
 
390 aa  72  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.56 
 
 
397 aa  70.9  4e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  21.3 
 
 
362 aa  70.5  5e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.43 
 
 
370 aa  70.1  6e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.44 
 
 
370 aa  68.6  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.01 
 
 
367 aa  68.6  2e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  20.78 
 
 
378 aa  67.8  3e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.99417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  23.21 
 
 
393 aa  67.8  3e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  20.6 
 
 
368 aa  67  6e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  22.96 
 
 
364 aa  66.6  7e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  21.6 
 
 
410 aa  66.6  8e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  23.32 
 
 
390 aa  66.2  9e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  22.82 
 
 
387 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  26.85 
 
 
365 aa  65.9  1e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.11 
 
 
393 aa  65.1  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  64.3  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  22.22 
 
 
388 aa  64.3  4e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  23.56 
 
 
390 aa  63.9  4e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  22.82 
 
 
387 aa  63.9  5e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  20.69 
 
 
357 aa  62.8  1e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23.59 
 
 
390 aa  62.4  1e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  23.59 
 
 
390 aa  62  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  22.25 
 
 
367 aa  61.2  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  23.61 
 
 
410 aa  61.2  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  22.25 
 
 
367 aa  61.2  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  27.23 
 
 
416 aa  60.8  4e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.27 
 
 
384 aa  60.1  6e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  22.05 
 
 
387 aa  60.1  6e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  31.19 
 
 
365 aa  59.7  9e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  27.07 
 
 
389 aa  59.3  1e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  25.67 
 
 
371 aa  58.2  2e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.96 
 
 
363 aa  58.9  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  22.53 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.22 
 
 
385 aa  57.8  3e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.77 
 
 
450 aa  57.4  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  30.82 
 
 
373 aa  56.6  8e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  23.98 
 
 
361 aa  55.8  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  21.81 
 
 
384 aa  55.8  1e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  23.2 
 
 
431 aa  55.8  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  29.63 
 
 
395 aa  55.8  1e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  30.56 
 
 
395 aa  55.5  2e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.5 
 
 
363 aa  55.5  2e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  31.58 
 
 
388 aa  53.9  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  24.86 
 
 
382 aa  53.9  5e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  20.79 
 
 
385 aa  53.5  6e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  23.18 
 
 
385 aa  53.5  6e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  44.78 
 
 
385 aa  53.1  9e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  1.52095e-07  unclonable  1.48287e-08 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  30.34 
 
 
388 aa  52.4  1e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  34.52 
 
 
388 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  23.94 
 
 
394 aa  52  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0105  SMC domain protein  41.82 
 
 
543 aa  52  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  30 
 
 
390 aa  51.6  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  30.1 
 
 
390 aa  52  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  30.39 
 
 
387 aa  52  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  30.34 
 
 
390 aa  51.6  2e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  22.08 
 
 
370 aa  51.2  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  30.1 
 
 
390 aa  51.2  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  29.13 
 
 
390 aa  50.8  4e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>