30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0052 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 
441 aa  877  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  52.34 
 
 
392 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  51.89 
 
 
405 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  51.65 
 
 
401 aa  408  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  49.77 
 
 
397 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  49.53 
 
 
391 aa  400  1e-110  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  49.3 
 
 
391 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  48.48 
 
 
391 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  53.15 
 
 
404 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  46.26 
 
 
404 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  48.48 
 
 
391 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  47.03 
 
 
395 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  45.2 
 
 
403 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  45.01 
 
 
395 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  34.95 
 
 
384 aa  202  1e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  32.03 
 
 
394 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  37.46 
 
 
387 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  58.09 
 
 
145 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  31.22 
 
 
429 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  31.2 
 
 
398 aa  130  5e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  27.08 
 
 
413 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  28.61 
 
 
426 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  27 
 
 
383 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  29.3 
 
 
408 aa  65.9  1e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  49.23 
 
 
92 aa  65.1  2e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  26.83 
 
 
384 aa  63.5  6e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  27.52 
 
 
394 aa  63.2  8e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  45.12 
 
 
101 aa  62  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  30 
 
 
381 aa  56.6  9e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.57228e-12  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  24.34 
 
 
412 aa  50.1  9e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>