36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0048 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  66.32 
 
 
482 aa  638  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  66.32 
 
 
481 aa  642  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  955  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  71.49 
 
 
484 aa  668  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  65.7 
 
 
482 aa  631  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  64.01 
 
 
510 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  64.01 
 
 
494 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  65.7 
 
 
480 aa  611  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  65.77 
 
 
483 aa  606  1e-172  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  65.91 
 
 
481 aa  606  1e-172  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  64.46 
 
 
482 aa  602  1e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  64.63 
 
 
488 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  53.32 
 
 
478 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  51.86 
 
 
486 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  51.13 
 
 
510 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  62.61 
 
 
412 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  49.9 
 
 
489 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  32.37 
 
 
489 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  31.93 
 
 
490 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  29.77 
 
 
487 aa  173  6e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  48.86 
 
 
176 aa  166  7e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  27.52 
 
 
488 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.59 
 
 
490 aa  137  6e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  28.31 
 
 
515 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  27.96 
 
 
487 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.18 
 
 
538 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.27047e-10  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  27.45 
 
 
499 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  25.08 
 
 
450 aa  77  6e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  23.36 
 
 
485 aa  65.5  2e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  26.3 
 
 
499 aa  60.5  7e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.44 
 
 
482 aa  57  8e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  27.73 
 
 
477 aa  55.1  3e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.42 
 
 
522 aa  51.6  3e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  27.38 
 
 
490 aa  50.4  6e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  26.67 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  24.7 
 
 
502 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>