22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0038 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  38 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3298  hypothetical protein  29.63 
 
 
164 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  26 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  37.8 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  32.76 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  40.24 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  34.19 
 
 
481 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  23.96 
 
 
596 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  33.66 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  28.85 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  32.11 
 
 
507 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  25.78 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  27.97 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  36.36 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  27.03 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  34.78 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>