58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0031 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  100 
 
 
544 aa  1087  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  35.45 
 
 
1016 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  35.45 
 
 
1016 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.41 
 
 
1363 aa  117  7e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.8 
 
 
1348 aa  112  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1279 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 
1279 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 
1373 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17344e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  31 
 
 
1048 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.26 
 
 
947 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28 
 
 
825 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04604e-08 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.67 
 
 
880 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.67 
 
 
880 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.78 
 
 
1656 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 
713 aa  59.7  1e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.74 
 
 
449 aa  59.7  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 
479 aa  58.9  3e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.13 
 
 
969 aa  56.2  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.04 
 
 
1155 aa  55.1  3e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.19 
 
 
472 aa  55.1  4e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
445 aa  54.7  5e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.9 
 
 
554 aa  54.3  6e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31 
 
 
718 aa  53.9  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  39.47 
 
 
576 aa  53.1  1e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
495 aa  53.1  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  32.88 
 
 
486 aa  53.1  1e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  32.61 
 
 
598 aa  52.8  2e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.71 
 
 
490 aa  52  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 
584 aa  52  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
1526 aa  51.6  4e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.11 
 
 
778 aa  51.2  4e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  29.63 
 
 
137 aa  51.2  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.44 
 
 
502 aa  50.8  6e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  31.48 
 
 
627 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  34.78 
 
 
325 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  31.51 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.53 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.79 
 
 
485 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 
839 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 
708 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  30.77 
 
 
367 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
481 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  36.25 
 
 
499 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.67 
 
 
728 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.05 
 
 
1056 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  27.56 
 
 
292 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
971 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 
486 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 
818 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  28.87 
 
 
942 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  32.56 
 
 
796 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  32.2 
 
 
570 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  25.78 
 
 
290 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 
845 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2024  TIR protein  31.96 
 
 
163 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
988 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>