14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0030 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0030  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  219  1e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  46.27 
 
 
119 aa  57.4  7e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  30.1 
 
 
120 aa  53.5  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  30.69 
 
 
118 aa  53.5  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  36.92 
 
 
120 aa  51.2  5e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  5.80905e-14 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  48.5  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  30.3 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  29.29 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  30.3 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  30.3 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  34.15 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  34.15 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  28.17 
 
 
115 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>