63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0028 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
509 aa  1042  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  60.67 
 
 
504 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  53.69 
 
 
507 aa  517  1e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  49.9 
 
 
461 aa  459  1e-128  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  63.81 
 
 
448 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  35.81 
 
 
527 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  39.78 
 
 
418 aa  202  1e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  2.36385e-07  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  41.91 
 
 
418 aa  201  2e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  39.57 
 
 
439 aa  197  5e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  46.53 
 
 
240 aa  173  7e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  7.87089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  49.09 
 
 
474 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  36.46 
 
 
415 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  33.87 
 
 
426 aa  149  1e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.92 
 
 
275 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.71 
 
 
507 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.71 
 
 
501 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.1 
 
 
508 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  31.1 
 
 
496 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  86.3  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  86.3  1e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  31.71 
 
 
421 aa  86.3  1e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  31.1 
 
 
564 aa  86.7  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.1 
 
 
483 aa  86.3  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  31.1 
 
 
477 aa  85.9  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.1 
 
 
483 aa  85.9  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.88 
 
 
381 aa  85.5  2e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  30.41 
 
 
478 aa  84.7  3e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  31.1 
 
 
472 aa  84.7  4e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  29.8 
 
 
480 aa  84  6e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30.49 
 
 
440 aa  82.8  1e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  82  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  27.92 
 
 
264 aa  75.9  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  27.01 
 
 
253 aa  67.4  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  67  7e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  26.64 
 
 
253 aa  66.6  9e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  65.9  2e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  25.37 
 
 
260 aa  62.8  1e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28.66 
 
 
412 aa  57.8  5e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.48 
 
 
251 aa  56.2  1e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  25.27 
 
 
842 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  25.27 
 
 
787 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  24.75 
 
 
272 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32 
 
 
432 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  29.13 
 
 
263 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  29.89 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  26.74 
 
 
190 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.28 
 
 
789 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  29.48 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  26.34 
 
 
189 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  1.24155e-10  unclonable  3.64355e-08 
 
 
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  32.58 
 
 
249 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  26 
 
 
268 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 
259 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  25.47 
 
 
254 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  36.36 
 
 
276 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  31.33 
 
 
262 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  23.6 
 
 
600 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  3.82798e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  26.29 
 
 
190 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  26.29 
 
 
190 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  26.14 
 
 
191 aa  43.5  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  26.29 
 
 
190 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  26.97 
 
 
432 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>