26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0018 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1231  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  27.05 
 
 
628 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  21.09 
 
 
638 aa  61.2  5e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  3.81885e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  21.09 
 
 
638 aa  61.2  5e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  21.09 
 
 
638 aa  61.2  5e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  21.09 
 
 
638 aa  61.2  5e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  27.71 
 
 
322 aa  58.5  3e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  33.78 
 
 
433 aa  57  1e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2265  hypothetical protein  26.07 
 
 
852 aa  55.1  3e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  30.57 
 
 
504 aa  55.1  3e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  26.92 
 
 
694 aa  55.5  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  22.27 
 
 
488 aa  54.7  5e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  39.06 
 
 
363 aa  53.1  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  36.76 
 
 
313 aa  53.1  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  36.76 
 
 
313 aa  53.1  1e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  33.82 
 
 
410 aa  52.4  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  23.71 
 
 
609 aa  52  3e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  37.84 
 
 
397 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  33.82 
 
 
410 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  32.67 
 
 
597 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  24.61 
 
 
567 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3661  hypothetical protein  26.99 
 
 
826 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  25.9 
 
 
183 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  26.87 
 
 
661 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  26.02 
 
 
307 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  27.66 
 
 
506 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>