46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0017 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  682  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  32.31 
 
 
311 aa  115  9e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  35.42 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  29.06 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  26.79 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  28.06 
 
 
377 aa  82.8  7e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  26.5 
 
 
330 aa  76.6  5e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25.47 
 
 
312 aa  76.6  6e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25.47 
 
 
312 aa  76.6  6e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25.47 
 
 
312 aa  75.5  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  30.18 
 
 
319 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  30.18 
 
 
319 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  30.18 
 
 
319 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  30.18 
 
 
319 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  2.41771e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  21.71 
 
 
315 aa  63.2  6e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.81 
 
 
304 aa  63.2  7e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  24.28 
 
 
313 aa  58.5  2e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  28.66 
 
 
345 aa  58.5  2e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  25.15 
 
 
440 aa  54.7  2e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  24.62 
 
 
316 aa  53.9  4e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  25.45 
 
 
310 aa  52.8  9e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  26.1 
 
 
301 aa  52.4  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  26.57 
 
 
297 aa  51.2  2e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.54 
 
 
300 aa  51.6  2e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  22.93 
 
 
327 aa  51.2  3e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  22.67 
 
 
294 aa  51.2  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  26.1 
 
 
301 aa  50.4  4e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  26.74 
 
 
351 aa  50.4  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  25.29 
 
 
301 aa  50.4  5e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25.57 
 
 
308 aa  50.4  5e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  29.48 
 
 
301 aa  50.1  6e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  29.48 
 
 
301 aa  50.1  6e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  23.39 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  23.42 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  27.53 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  24.86 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  27.44 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  25.48 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  22.86 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  23.37 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  25.48 
 
 
552 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.84 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  23.26 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  23.26 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  23.26 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>