72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0016 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0016  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1362  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.87 
 
 
651 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
630 aa  85.9  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25.94 
 
 
626 aa  83.2  1e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  22.6 
 
 
618 aa  80.9  7e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  22.6 
 
 
618 aa  80.9  7e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.81 
 
 
618 aa  77.8  7e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
556 aa  76.6  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
556 aa  76.6  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
556 aa  76.6  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
556 aa  76.6  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.77 
 
 
548 aa  75.9  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 
551 aa  75.5  3e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  24.46 
 
 
617 aa  74.7  4e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  24.8 
 
 
617 aa  73.6  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  27.3 
 
 
652 aa  72  3e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.36 
 
 
382 aa  72  3e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  27.3 
 
 
652 aa  72  3e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  27.3 
 
 
652 aa  72  3e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  27.3 
 
 
677 aa  72  3e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  2.81565e-07 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  68.2  4e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  68.2  4e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  68.2  4e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  68.2  4e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  25.06 
 
 
422 aa  67.8  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.9 
 
 
640 aa  67.4  7e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.92 
 
 
632 aa  67.4  8e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  21.33 
 
 
626 aa  67  9e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.32 
 
 
572 aa  66.2  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 
509 aa  65.9  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.32 
 
 
562 aa  65.9  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  22.27 
 
 
616 aa  65.5  3e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.92 
 
 
640 aa  65.5  3e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  24 
 
 
640 aa  65.1  4e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  24 
 
 
640 aa  65.1  4e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  27.34 
 
 
560 aa  64.7  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
547 aa  63.9  8e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.87 
 
 
552 aa  62.8  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  24 
 
 
554 aa  63.2  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.58 
 
 
636 aa  62.4  3e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  21.6 
 
 
650 aa  61.2  6e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.74 
 
 
653 aa  60.8  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.83 
 
 
721 aa  60.1  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  21.21 
 
 
625 aa  59.7  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  21.35 
 
 
663 aa  58.9  3e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.55 
 
 
611 aa  58.9  3e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.25 
 
 
810 aa  58.5  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  25 
 
 
662 aa  58.2  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  25 
 
 
662 aa  58.2  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  25 
 
 
575 aa  58.2  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.26 
 
 
542 aa  57.8  6e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
599 aa  57.8  7e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
599 aa  57.8  7e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.97 
 
 
670 aa  57  1e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  21.55 
 
 
547 aa  56.2  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  22.63 
 
 
595 aa  56.2  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  25.78 
 
 
555 aa  55.1  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13728e-05 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  25.88 
 
 
497 aa  54.7  6e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.87 
 
 
649 aa  53.1  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.41 
 
 
561 aa  51.6  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
560 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  32.48 
 
 
715 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.53 
 
 
581 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.12 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.12 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  29.15 
 
 
801 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  21.08 
 
 
636 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  24.61 
 
 
791 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.84 
 
 
560 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  22.18 
 
 
291 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  28.36 
 
 
782 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>