19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0008 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0008  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  144  4e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4038  Ankyrin  91.43 
 
 
70 aa  129  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3157  hypothetical protein  91.43 
 
 
70 aa  129  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2088  hypothetical protein  91.43 
 
 
70 aa  129  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0315  hypothetical protein  91.43 
 
 
70 aa  129  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0812302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5478  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285115  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4422  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000576812  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3929  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000152296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3140  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2835  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.96705  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6337  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.1689e-07  hitchhiker  3.53207e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0319  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.677266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1998  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2010  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00748891  normal  0.0867555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2407  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000110806  decreased coverage  3.00307e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2550  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5943  hypothetical protein  62.96 
 
 
71 aa  68.6  3e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173026  normal  0.986624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3282  hypothetical protein  42.59 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4883  hypothetical protein  42.59 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>