More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0012 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>