56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1929 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1929  peptidase M55, D-aminopeptidase  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0142981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0500  peptidase M55 D-aminopeptidase  55.81 
 
 		 272 aa  331  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1790  peptidase M55 D-aminopeptidase  55.19 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1594  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.12 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0351  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4003  peptidase M55 D-aminopeptidase  28.62 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0365991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4322  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.42 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0312  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.41 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1265  D-aminopeptidase DppA  28.52 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00495776  hitchhiker  0.000000282701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2925  peptidase M55 D-aminopeptidase  29.86 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5273  D-aminopeptidase  29.72 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8120  D-aminopeptidase  28.57 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1922  D-aminopeptidase DppA  30.4 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3210  peptidase M55 D-aminopeptidase  28.21 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2747  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.98 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19920  D-aminopeptidase DppA  27.82 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000508019  decreased coverage  0.0000487782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1412  D-aminopeptidase DppA  29.14 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0142  peptidase M55 D-aminopeptidase  25.98 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0164001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3239  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.9 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4113  peptidase M55 D-aminopeptidase  24.82 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.951094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2851  peptidase M55 D-aminopeptidase  29.89 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0564974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7323  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4402  peptidase M55 D-aminopeptidase  24.82 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3975  peptidase M55 D-aminopeptidase  25.18 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1662  D-aminopeptidase DppA  26.33 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3107  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.45 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1257  peptidase M55 D-aminopeptidase  28.06 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1323  peptidase M55 D-aminopeptidase  28.06 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.035577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0135  D-aminopeptidase DppA  28.29 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0629  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.21 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0390191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4221  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.95 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436913  normal  0.615325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0706  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.28 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1384  hypothetical protein  25.63 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.803903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4199  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.67 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4167  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.67 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3349  peptidase M55 D-aminopeptidase  25.7 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5860  peptidase M55 D-aminopeptidase  25.77 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1863  D-aminopeptidase DppA  26.54 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3467  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.12 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3007  peptidase M55 D-aminopeptidase  24.55 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3575  peptidase M55, D-aminopeptidase  25 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00281601  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1117  dipeptide transport protein, putative  26.77 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.350409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1743  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.37 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0783265  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4056  peptidase M55 D-aminopeptidase  25.35 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0840  D-aminopeptidase DppA  26.92 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0243  putative dipeptide transport protein  26.77 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.997125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0397  putative dipeptide transport protein  26.77 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.583711  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1763  putative dipeptide transport protein  26.77 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1353  putative dipeptide transport protein  26.77 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0320  peptidase  26.77 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0979  putative dipeptide transport protein  26.77 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1848  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.77 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1020  peptidase M55 D-aminopeptidase  23.27 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4595  peptidase M55, D-aminopeptidase  23.74 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3126  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.31 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4422  peptidase M55 D-aminopeptidase  24.32 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>