More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1910 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  51.47 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  51.47 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  47.57 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  43.6 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  50 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  47.4 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.99 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  49.19 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.9 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.24 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  49.72 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  48.9 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.81 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  45.74 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.87 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  38.35 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.21 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  49.2 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>