More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1905 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 477 aa  943    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  62.61 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  62.36 
 
 		 465 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  62.14 
 
 		 465 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.86 
 
 		 524 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.07 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.87 
 
 		 533 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.19 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 		 403 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.5 
 
 		 533 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37 
 
 		 533 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.98 
 
 		 531 aa  226  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.46 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.15 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.42 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.02 
 
 		 532 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  34.64 
 
 		 534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.5 
 
 		 594 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.5 
 
 		 594 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  34.08 
 
 		 473 aa  220  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  33.76 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  35.98 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 		 534 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  34.16 
 
 		 554 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.16 
 
 		 554 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  36.66 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  33.88 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  33.17 
 
 		 399 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.14 
 
 		 740 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.83 
 
 		 853 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  32.81 
 
 		 534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.12 
 
 		 849 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  33.85 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  33.85 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  31.7 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.05 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.4 
 
 		 530 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  33.64 
 
 		 471 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.92 
 
 		 848 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.27 
 
 		 991 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.17 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  35.17 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  37.06 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  34.65 
 
 		 554 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.74 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  32.86 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  33.94 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.14 
 
 		 759 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  32.82 
 
 		 554 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  32.1 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.67 
 
 		 533 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  32.22 
 
 		 533 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  33.56 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.02 
 
 		 616 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  32.56 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.67 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  29.68 
 
 		 613 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 537 aa  203  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  35.71 
 
 		 533 aa  203  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  32.28 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  29.47 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.07 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.85 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.57 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  34.96 
 
 		 531 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.84 
 
 		 856 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 534 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 843 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.19 
 
 		 856 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  32.3 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  32.37 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  43.04 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  38.23 
 
 		 1001 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  31.68 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  31.65 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  34.4 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 625 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.86 
 
 		 995 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  32.73 
 
 		 595 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  28.67 
 
 		 613 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.58 
 
 		 844 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  42.6 
 
 		 1029 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.53 
 
 		 735 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  30.68 
 
 		 470 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  40.78 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  34.12 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.79 
 
 		 594 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  40.78 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30.66 
 
 		 406 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>