More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1821 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
403 aa  816    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  63.21 
 
 
406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  53.07 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  53.07 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  48.14 
 
 
414 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 
410 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  40.92 
 
 
416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  40.97 
 
 
474 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  41.33 
 
 
402 aa  319  7e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  41.13 
 
 
401 aa  317  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  40.56 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  40.77 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
397 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
411 aa  297  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
419 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 
411 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
411 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  38.31 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
417 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  36.78 
 
 
420 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
407 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
497 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  26.77 
 
 
705 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  27.81 
 
 
734 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.89 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
819 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.62 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.62 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.62 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.77 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
821 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.62 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.11 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  25.76 
 
 
431 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
821 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.62 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.82 
 
 
423 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
822 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.12 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  25.45 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
765 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0134  glycosyl transferase, group 1  20.81 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  23.3 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.11 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  28.11 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
382 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  24.8 
 
 
458 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
377 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
398 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  26.19 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.41 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  23.37 
 
 
351 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  25.24 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
818 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  24.76 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>