More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1816 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
514 aa  1002    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 
465 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.98 
 
 
670 aa  184  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 
666 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
566 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 
667 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 
667 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 
668 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
657 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
748 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
663 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
660 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.93 
 
 
660 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
664 aa  161  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
664 aa  161  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
662 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
656 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
661 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
656 aa  160  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1300  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
578 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.69 
 
 
659 aa  156  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.24 
 
 
630 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 
658 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.53 
 
 
564 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 
661 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  28.87 
 
 
658 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 
588 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.415929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 
689 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 
541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  29.26 
 
 
660 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 
655 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.17 
 
 
632 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 
541 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.9 
 
 
540 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.73 
 
 
650 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 
689 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
660 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  30.52 
 
 
564 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000913296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  30.3 
 
 
564 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 
564 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  30.79 
 
 
564 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 
542 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  30.3 
 
 
564 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.98 
 
 
630 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 
452 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  28.91 
 
 
629 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  28.06 
 
 
564 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  28.91 
 
 
632 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  29.66 
 
 
660 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5185  methyl-accepting chemotaxis protein  28.16 
 
 
564 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00149704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 
650 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 
650 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 
660 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.66 
 
 
660 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  27.89 
 
 
658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  28.91 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.86 
 
 
660 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.05 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.86 
 
 
660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 
540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.2 
 
 
658 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5181  methyl-accepting chemotaxis protein  28.87 
 
 
563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000942928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 
563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.97 
 
 
624 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  27.89 
 
 
658 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1024  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
575 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  27.89 
 
 
658 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.62 
 
 
624 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 
563 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  27.63 
 
 
658 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.17 
 
 
588 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
566 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1046  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
575 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1125  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
575 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  28.41 
 
 
563 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
625 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.42 
 
 
629 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 
644 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  29.23 
 
 
563 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  29.23 
 
 
563 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  29.23 
 
 
563 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
564 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
540 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.62 
 
 
624 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4905  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 
563 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5280  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 
563 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0063  methyl-accepting chemotaxis protein  28.68 
 
 
563 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000482836  normal  0.0217071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 
540 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  27.3 
 
 
579 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 
624 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.04 
 
 
557 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.83 
 
 
588 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 
626 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 
629 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.34 
 
 
660 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5186  methyl-accepting chemotaxis protein  30.68 
 
 
563 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  30.11 
 
 
629 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>