More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1808 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
510 aa  990    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.22 
 
 
515 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
572 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 
606 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.77 
 
 
663 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
512 aa  143  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.33 
 
 
565 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
634 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.9 
 
 
597 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.18 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
569 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.26 
 
 
547 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
544 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  28.45 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.11 
 
 
564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  34.74 
 
 
592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  24.62 
 
 
523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
528 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
565 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  24.95 
 
 
521 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  21.18 
 
 
576 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.11 
 
 
550 aa  103  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  32.09 
 
 
504 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  32.97 
 
 
504 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  24.47 
 
 
531 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
601 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  31.91 
 
 
504 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  22.82 
 
 
514 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.76 
 
 
509 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
569 aa  95.5  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  27.82 
 
 
534 aa  94.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  22.11 
 
 
543 aa  93.2  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  22.64 
 
 
516 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  30.04 
 
 
542 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  22.15 
 
 
530 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.06 
 
 
551 aa  91.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  23.78 
 
 
541 aa  91.3  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  25.84 
 
 
540 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.81 
 
 
563 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  32.85 
 
 
536 aa  87.8  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  31.11 
 
 
287 aa  87  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.72 
 
 
692 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
569 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  28.36 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.34 
 
 
758 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  28.36 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  26.67 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  30.43 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  27.42 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  28.36 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  27.14 
 
 
516 aa  84  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  21.75 
 
 
545 aa  83.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
234 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.63 
 
 
263 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  27.04 
 
 
270 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  25.83 
 
 
278 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  28.96 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.5 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  28.05 
 
 
536 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.4 
 
 
728 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  28.71 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
536 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  26.85 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  27.6 
 
 
536 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  26.85 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  26.7 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  27.15 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  28.22 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  28.22 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  28.22 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.1 
 
 
229 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  28.71 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  27.15 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  28.71 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
255 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.08 
 
 
225 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 
536 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.45 
 
 
692 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
226 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  33.1 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.6 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.12 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.48 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  22.72 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  33.12 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.97 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  25.1 
 
 
269 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.83 
 
 
232 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.37 
 
 
230 aa  77  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
585 aa  77  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.21 
 
 
579 aa  77  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>