More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1776 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 664 aa  1309    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 664 aa  1309    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.78 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.28 
 
 		 656 aa  249  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 661 aa  247  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 661 aa  247  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 656 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 662 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 655 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 666 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 670 aa  213  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 657 aa  212  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 668 aa  211  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 667 aa  210  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.71 
 
 		 660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.44 
 
 		 689 aa  197  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.87 
 
 		 658 aa  191  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 566 aa  190  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  26.73 
 
 		 658 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  26.73 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  26.73 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.28 
 
 		 659 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.58 
 
 		 658 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  27.02 
 
 		 658 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.9 
 
 		 677 aa  179  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  25.96 
 
 		 658 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  26.87 
 
 		 658 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.7 
 
 		 660 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  35.41 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 465 aa  175  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  25.74 
 
 		 658 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.91 
 
 		 681 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 564 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 588 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.415929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 565 aa  170  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.77 
 
 		 655 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  28.31 
 
 		 650 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.94 
 
 		 660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  28.31 
 
 		 650 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  28.1 
 
 		 650 aa  168  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  28.31 
 
 		 660 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 777 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.02 
 
 		 656 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 693 aa  167  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 537 aa  167  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  29.05 
 
 		 660 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 679 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 675 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  27.69 
 
 		 660 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 		 679 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.25 
 
 		 660 aa  163  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.88 
 
 		 659 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.3 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 		 663 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 660 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 660 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 660 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 660 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 563 aa  160  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.19 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.34 
 
 		 599 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 		 542 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 452 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 411 aa  158  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 560 aa  157  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.7 
 
 		 630 aa  157  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  32.74 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  28.54 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  32.74 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  32.74 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 		 654 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 		 661 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  32.74 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000913296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.12 
 
 		 650 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.31 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 677 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1439  methyl-accepting chemotaxis protein  31.48 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181327  hitchhiker  0.0000921474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>