More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1738 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 
122 aa  167  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 
122 aa  166  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  70 
 
 
120 aa  157  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  62.83 
 
 
116 aa  143  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 
125 aa  136  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 
123 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  51.72 
 
 
124 aa  127  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
126 aa  127  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 
123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 
124 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 
125 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 
126 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 
124 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 
126 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 
122 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  47.5 
 
 
160 aa  122  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 
122 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 
128 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 
124 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  56.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
126 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 
120 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
125 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 
126 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 
124 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
126 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
126 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 
129 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
129 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 
122 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  49.18 
 
 
177 aa  121  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  50 
 
 
130 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  43.59 
 
 
135 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 
129 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
123 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 
126 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 
122 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 
125 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  51.69 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  45.83 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 
130 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 
124 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
129 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
122 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 
120 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>