More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1735 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 345 aa  687    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.91 
 
 		 345 aa  514  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.17 
 
 		 345 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000046996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.17 
 
 		 345 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000706294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.09 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.242543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.94 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000400167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.36 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.73 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.44 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.95 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.95 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  38.66 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.95 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.95 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.95 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  38.66 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  37.9 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  38.08 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 321 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  36.73 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.1 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  37.1 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  38.26 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 		 311 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.73 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  37.03 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  35.86 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  35.86 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  37.03 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.21 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.6 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 		 364 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 		 333 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 321 aa  206  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  34.69 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  36.63 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.31 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  34.96 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  36.89 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  36.34 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  36.6 
 
 		 336 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.4 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>