More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1634 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  667    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  45.45 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  42.99 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  38.82 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  38.63 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  36.91 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.64 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.04 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.04 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.74 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.04 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  33.53 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.34 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.65 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.64 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.63 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  31.02 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  34.05 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.64 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.1 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.1 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  30.61 
 
 		 354 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.38 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  31.71 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.17 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.17 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.7 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  32.33 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  30.37 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.78 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.91 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.79 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.25 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.28 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.34 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.61 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.45 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.45 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.45 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  30.19 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.66 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.66 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.99 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.42 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  31.99 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.62 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  30.12 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  34.08 
 
 		 182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 		 531 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.53 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.63 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.43 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.45 
 
 		 395 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  24.43 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  26.64 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  26.93 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  28.19 
 
 		 232 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  28.72 
 
 		 546 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.92 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 399 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  33.09 
 
 		 146 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 693 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  24.83 
 
 		 368 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  27.23 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 		 457 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.43 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 660 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  24.09 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  21.37 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  25.45 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  32.94 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  22.3 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.73 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  23.1 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>