169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1629 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  59.83 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  50.5 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  51.55 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  39 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  36.04 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  40.54 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.74 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  37.84 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  37.84 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  37.84 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  37.84 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37.04 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  37.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  37.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  37.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  37.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  37.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.79 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  37.84 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  36.94 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  39.51 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.53 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  31.75 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  43.04 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  38.46 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.35 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.26 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  35.78 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  34.55 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  34.55 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  32.26 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  38.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  38.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.62 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  30.7 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  38.1 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.71 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  40.48 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  38.78 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  37.89 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  32.14 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  40.23 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2399  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.71543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  31.48 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  29.2 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  38.95 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  31.48 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  30.95 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.71 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  36.17 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  31.53 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  37.21 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  30.95 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  34.21 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  31.36 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  36.36 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  36.36 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  33.33 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  44 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  39.81 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  28.81 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  35.96 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  31.18 
 
 		 162 aa  48.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  32.97 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  27.42 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  35.48 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  33.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  31.58 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  35.62 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>