164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1588 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  100 
 
 
167 aa  312  1e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  58.79 
 
 
174 aa  187  6e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  48.15 
 
 
184 aa  129  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  44.38 
 
 
169 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  44.38 
 
 
169 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  37.93 
 
 
182 aa  107  8e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  42.94 
 
 
171 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.84 
 
 
179 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  37.13 
 
 
184 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.46 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.43 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.2 
 
 
192 aa  94.4  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  40 
 
 
203 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  38.36 
 
 
179 aa  90.5  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.88 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.24 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  37.71 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.88 
 
 
182 aa  89  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  36.42 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  36.97 
 
 
195 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38.16 
 
 
189 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  35.09 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  33.14 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  37.5 
 
 
205 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.91 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  47.87 
 
 
208 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.37 
 
 
224 aa  84  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  33.71 
 
 
197 aa  83.2  1e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  34.27 
 
 
197 aa  83.6  1e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  44.53 
 
 
184 aa  84  1e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  42.66 
 
 
175 aa  82.8  2e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  36.36 
 
 
193 aa  82.8  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.81 
 
 
169 aa  81.3  6e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.71 
 
 
207 aa  80.1  1e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.58 
 
 
169 aa  79.3  2e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.5 
 
 
206 aa  79.7  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  36.09 
 
 
187 aa  77.8  7e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.4 
 
 
192 aa  76.6  1e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  38.27 
 
 
190 aa  77  1e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  33.14 
 
 
191 aa  75.5  3e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  33.14 
 
 
191 aa  75.5  3e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  31.84 
 
 
187 aa  75.5  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  33.53 
 
 
182 aa  75.1  4e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  37.58 
 
 
193 aa  75.5  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  34.55 
 
 
193 aa  74.3  8e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.89 
 
 
180 aa  73.6  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  34.03 
 
 
197 aa  73.6  1e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  35.47 
 
 
190 aa  73.6  1e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  72  4e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  30.37 
 
 
231 aa  71.2  5e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  31.71 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  29.57 
 
 
201 aa  69.3  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.46 
 
 
216 aa  69.7  2e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  35.5 
 
 
179 aa  68.9  3e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 
192 aa  68.9  3e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  30.9 
 
 
197 aa  68.9  3e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  33.9 
 
 
188 aa  68.6  4e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  34.73 
 
 
189 aa  68.6  4e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  33.52 
 
 
187 aa  68.2  5e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.05792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  34.97 
 
 
185 aa  67.8  7e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  30.77 
 
 
197 aa  67.4  9e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  30.77 
 
 
197 aa  67.4  9e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  35.62 
 
 
176 aa  67.4  9e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.08 
 
 
195 aa  67  1e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  30.17 
 
 
205 aa  67  1e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  32.16 
 
 
212 aa  67.4  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.22 
 
 
197 aa  66.2  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.22 
 
 
197 aa  66.2  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.22 
 
 
197 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  34.38 
 
 
189 aa  65.5  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  30.22 
 
 
197 aa  65.1  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  32.87 
 
 
204 aa  65.1  4e-10  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  33.76 
 
 
220 aa  65.1  4e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  31.4 
 
 
189 aa  64.7  6e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40.83 
 
 
202 aa  64.7  6e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  28.42 
 
 
197 aa  64.3  7e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.01818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35 
 
 
182 aa  63.5  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  29.12 
 
 
197 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  30.92 
 
 
207 aa  63.9  1e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  33.58 
 
 
235 aa  63.9  1e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  33.78 
 
 
193 aa  62.8  2e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.64 
 
 
210 aa  63.2  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  30.41 
 
 
180 aa  63.2  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  34.48 
 
 
192 aa  63.2  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  34.36 
 
 
200 aa  62  3e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  39.76 
 
 
216 aa  62.4  3e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.63 
 
 
169 aa  62  3e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  28.8 
 
 
198 aa  62.4  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.77 
 
 
203 aa  61.6  5e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.15 
 
 
177 aa  61.2  6e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  34.64 
 
 
225 aa  61.2  6e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  31.14 
 
 
187 aa  61.2  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  34.67 
 
 
165 aa  60.8  8e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  28.57 
 
 
197 aa  60.8  9e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.36 
 
 
179 aa  60.8  9e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  32.58 
 
 
187 aa  60.1  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  30.77 
 
 
188 aa  60.1  1e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.91401e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.98 
 
 
180 aa  60.1  1e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.62 
 
 
212 aa  60.1  1e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  33.77 
 
 
208 aa  59.3  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>