135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1543 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 1096 aa  2188    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  33.19 
 
 		 1111 aa  614  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  47.09 
 
 		 1061 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  46.74 
 
 		 1061 aa  548  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  41.68 
 
 		 1153 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 1040 aa  193  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 		 364 aa  151  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 356 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 389 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.04 
 
 		 392 aa  98.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.97 
 
 		 403 aa  97.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.94 
 
 		 418 aa  94.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 365 aa  94.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.73 
 
 		 400 aa  94  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.16 
 
 		 359 aa  93.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.8 
 
 		 384 aa  90.1  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.2 
 
 		 394 aa  89.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  20.17 
 
 		 358 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  25.27 
 
 		 360 aa  87.8  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 360 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.87 
 
 		 362 aa  86.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.34 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 442 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.29 
 
 		 386 aa  83.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 389 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.77 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 391 aa  81.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.43 
 
 		 359 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.75 
 
 		 401 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 358 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.9 
 
 		 401 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 337 aa  77  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 357 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.22 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.95 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 361 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 792 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 		 370 aa  73.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  26.34 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  21.47 
 
 		 442 aa  72  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 364 aa  70.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 441 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  27.84 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  20.55 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 360 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  19.39 
 
 		 369 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  20.06 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.5 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  21.88 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  22.15 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  22.91 
 
 		 377 aa  64.3  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  20.54 
 
 		 380 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 359 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  19.64 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  20.99 
 
 		 359 aa  61.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  20.49 
 
 		 360 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.01 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  18.59 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  22.65 
 
 		 418 aa  58.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  22.84 
 
 		 367 aa  57.4  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  21.8 
 
 		 379 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 423 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  23.75 
 
 		 403 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 		 402 aa  57.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 498 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 360 aa  56.2  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  24.47 
 
 		 483 aa  55.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 		 527 aa  55.1  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 359 aa  55.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  20.49 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  34.94 
 
 		 359 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>