More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1514 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1514  NusB/RsmB/TIM44  100 
 
 		 416 aa  836    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  44.26 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  44.16 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.28 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.08 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.45 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.45 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  30.97 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.45 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.58 
 
 		 448 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.2 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.06 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.22 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.96 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  32.22 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  30.36 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  29.95 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  30.45 
 
 		 444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  30.47 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.81 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  30.23 
 
 		 433 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.72 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  28.95 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.56 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  29.57 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  29.63 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  29.63 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  30.14 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  29.97 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30.17 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  30.14 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.29 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  29.86 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  29.86 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  29.86 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  30.14 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  29.86 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  29.86 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  29.34 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  29.06 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  29.75 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  29.06 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  28.91 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  28.16 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  29.36 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  31.25 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  30.77 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.25 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.53 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  29.58 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  30.77 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  30.24 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  28.89 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  29.51 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.69 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.66 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  29.59 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  29.28 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.63 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.58 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  27.52 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.48 
 
 		 443 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  28.88 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  28.61 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.99 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.6 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  29.6 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.15 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  28.53 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  30.42 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  30.42 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  28.61 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  28.33 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  28.53 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  29.18 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  30.51 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  29.6 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.11 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  25.74 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.11 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  27.55 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  28.11 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.11 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  27.84 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  31.75 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  28.07 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  32.95 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  25.31 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.31 
 
 		 442 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>