More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1511 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  57.29 
 
 		 668 aa  766    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.12 
 
 		 669 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  48.71 
 
 		 673 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  65.15 
 
 		 688 aa  918    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  61.19 
 
 		 681 aa  853    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.5 
 
 		 669 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.1 
 
 		 670 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  48.33 
 
 		 672 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  65.15 
 
 		 688 aa  918    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.97 
 
 		 669 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.27 
 
 		 669 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 662 aa  1317    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.82 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.97 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.97 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.82 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.97 
 
 		 669 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.67 
 
 		 669 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.82 
 
 		 669 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  48.56 
 
 		 662 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  48.71 
 
 		 669 aa  621  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  46.68 
 
 		 663 aa  615  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 670 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.98 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 670 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 677 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.05 
 
 		 670 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 684 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  45.23 
 
 		 659 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  43.12 
 
 		 671 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 668 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 668 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  47.17 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 663 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 		 718 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  42.94 
 
 		 661 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 726 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.99 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  42.99 
 
 		 672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.48 
 
 		 676 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.18 
 
 		 683 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 672 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 685 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 		 681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  42.99 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 673 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.09 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  41.95 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 		 704 aa  555  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  42.39 
 
 		 678 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  43.67 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  42.38 
 
 		 680 aa  551  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  43.33 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  39.91 
 
 		 673 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.06 
 
 		 673 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  40.87 
 
 		 675 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.57 
 
 		 679 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  44.19 
 
 		 670 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 652 aa  545  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  41.06 
 
 		 684 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  41.91 
 
 		 683 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  42.54 
 
 		 673 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  44.68 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.18 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  40.36 
 
 		 673 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  40.76 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.97 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  45.08 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  42.41 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  38.92 
 
 		 712 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  42.09 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  40.51 
 
 		 671 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  44.7 
 
 		 668 aa  537  1e-151  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.65 
 
 		 697 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  40.29 
 
 		 708 aa  537  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  40.67 
 
 		 668 aa  538  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  41.04 
 
 		 680 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  40.63 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  38.76 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 680 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2086  DNA ligase, NAD-dependent  41.95 
 
 		 670 aa  535  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  41.16 
 
 		 670 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.68 
 
 		 697 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  40.89 
 
 		 677 aa  531  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.15 
 
 		 711 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.04 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.58 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  40.9 
 
 		 746 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  39.74 
 
 		 725 aa  530  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  40.9 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>