23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1491 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1491  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  85.9  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  55.26 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  48.84 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  59.46 
 
 
73 aa  47.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3535  hypothetical protein  56.76 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.907357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  54.05 
 
 
73 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1945  hypothetical protein  56.82 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0255588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1328  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  51.16 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  47.73 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13840  hypothetical protein  57.89 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  48.65 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  47.73 
 
 
63 aa  42  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1630  hypothetical protein  55.26 
 
 
68 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0928  hypothetical protein  48.72 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  45.24 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2520  hypothetical protein  51.28 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000165687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4499  hypothetical protein  51.43 
 
 
66 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  48.65 
 
 
74 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>