More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1436 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.04 
 
 
276 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.31 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 
302 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  30.77 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  32.24 
 
 
295 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
301 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  28.63 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
519 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
270 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 
274 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
288 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
283 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
298 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  29.58 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  31.15 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
275 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.97 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.98 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
302 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.27 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.91 
 
 
293 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 
271 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  24.81 
 
 
270 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  25.98 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  29.84 
 
 
272 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
281 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 
277 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  27.71 
 
 
272 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
297 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  24.66 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 
277 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 
276 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.87 
 
 
277 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
284 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  24.29 
 
 
277 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0659  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.41 
 
 
266 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
268 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.29 
 
 
277 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  29.51 
 
 
287 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  26.23 
 
 
313 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.79 
 
 
294 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  28.16 
 
 
280 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
290 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 
287 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
299 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 
276 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
273 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  25.56 
 
 
295 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  28.06 
 
 
275 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 
473 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  25.56 
 
 
295 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.07 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  22.59 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 
370 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  22.97 
 
 
280 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  22.97 
 
 
280 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  28.74 
 
 
289 aa  99  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  32.58 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  24.22 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  32.58 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0073  ParaA family ATPase  32.02 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  27.15 
 
 
309 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2024  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  25.3 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  24 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.9 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.52 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1412  hypothetical protein  23.11 
 
 
295 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.59 
 
 
308 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1011  cell division ATPase MinD  25.4 
 
 
262 aa  92  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.381941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  27.44 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  25.47 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.79 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1140  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.62 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0679  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.66 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0704  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 
291 aa  89  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>