51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1414 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
89 aa  174  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  66.29 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  64.37 
 
 
87 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  59.3 
 
 
90 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.1 
 
 
97 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.1 
 
 
97 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  55.42 
 
 
91 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  54.88 
 
 
91 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  55.06 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  53.01 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  49.44 
 
 
91 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.24 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  48.31 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  48.31 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  51.81 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  46.07 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  47.19 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  51.19 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.59 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  47.89 
 
 
71 aa  77  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  48.75 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3174  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.57 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00906812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.87 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.23 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.23 
 
 
123 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.23 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.03 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.03 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  33.33 
 
 
609 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.36 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  31.75 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.67 
 
 
127 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
163 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  32.26 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
124 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>