More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1377 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  68.42 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  54.97 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  46.1 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 175 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  44.94 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  45.33 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  44.08 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  46.76 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  41.72 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.45 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  47.24 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>