More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1353 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  879    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  53.67 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  42.13 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  40.23 
 
 		 441 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 500 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 486 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 500 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 518 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 500 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.5 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.38 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.94 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.99 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.41 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.06 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.64 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.41 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.46 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 443 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.09 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 456 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.57 
 
 		 478 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 438 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>