19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1332 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  748    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  69.23 
 
 		 380 aa  494  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06390  hypothetical protein  51.57 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  51.07 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0327  hypothetical protein  48.26 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  51.41 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  24.15 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  20.37 
 
 		 452 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  22.49 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  20.51 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  21.17 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  23.79 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  41.38 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  22.58 
 
 		 449 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  23.05 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  22.95 
 
 		 451 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  22.67 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  22.67 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>