17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1318 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 492 aa  1006    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  28.2 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  24.51 
 
 		 1236 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.55 
 
 		 496 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  27.72 
 
 		 2353 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  23.9 
 
 		 1096 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  24.33 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  23.02 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.46 
 
 		 1066 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  24.91 
 
 		 1092 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  24.62 
 
 		 272 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  25.38 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  22.14 
 
 		 812 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  21.76 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45795  predicted protein  19.71 
 
 		 666 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  23.73 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  24.55 
 
 		 1202 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>