More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1308 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  53.28 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  45.78 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 302 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 307 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  30.84 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.94 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 319 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  28.64 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.93 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.84 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  21.95 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.15 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  24.16 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  20.76 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.83 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.38 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.78 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.7 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  27.19 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.28 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.65 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  24.52 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  25.24 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.77 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.77 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  24.34 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  24.22 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.64 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  25.23 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  21.52 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  24.51 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  23.98 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.35 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  26.73 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  21.46 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>