98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1304 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  100 
 
 
200 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  62 
 
 
202 aa  264  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0035  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 
201 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0035  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 
201 aa  141  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1104  signal-transduction protein  30.05 
 
 
207 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  27.07 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  24.21 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  25.74 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  24.19 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  24.74 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  24.74 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  24.74 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  24.74 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  25.13 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  23.04 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  24.19 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  19.21 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  24.3 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  27.43 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  26.07 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  23.91 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.07 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  27.44 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  24.31 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  25.44 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  20.94 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  27.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 
232 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.5 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  21.31 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  24.86 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  29.41 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  22.97 
 
 
222 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.48 
 
 
490 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  22.66 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  20.31 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  20.32 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  26.96 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  25.17 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.85 
 
 
490 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  24.59 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  25.76 
 
 
154 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  24.08 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  26.55 
 
 
310 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  26.61 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  22.8 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  19.47 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  20.62 
 
 
489 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  22.94 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
488 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
490 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  20 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  23.35 
 
 
479 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.21 
 
 
606 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.71 
 
 
490 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  26.92 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  25.66 
 
 
217 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  30.56 
 
 
454 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  21.08 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  25.66 
 
 
377 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  25.28 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  25 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.22 
 
 
490 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  27.12 
 
 
498 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  27.96 
 
 
432 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  27.96 
 
 
432 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  24.49 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  26.61 
 
 
459 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  25.96 
 
 
435 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  25.28 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  27.43 
 
 
290 aa  42.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  22.29 
 
 
479 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  23.33 
 
 
131 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  24.71 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.89 
 
 
491 aa  42  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  25 
 
 
310 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  27.13 
 
 
214 aa  42  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  23.84 
 
 
479 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  25.83 
 
 
266 aa  41.6  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.76 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  28.35 
 
 
373 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 
615 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
386 aa  41.2  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>