More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1299 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
370 aa  729    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  61.07 
 
 
357 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50.41 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.14 
 
 
346 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.6 
 
 
372 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.22 
 
 
375 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  40.59 
 
 
401 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  41.25 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  41.58 
 
 
375 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.11 
 
 
422 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  39.9 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.35 
 
 
398 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  39.48 
 
 
360 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.69 
 
 
381 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  36.89 
 
 
402 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  34.55 
 
 
406 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  37.78 
 
 
411 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.15 
 
 
401 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  35.82 
 
 
395 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  33.94 
 
 
572 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  32.28 
 
 
375 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.55 
 
 
369 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  30.97 
 
 
554 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.79 
 
 
331 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  41.63 
 
 
545 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  40.09 
 
 
546 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  40.09 
 
 
546 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  44.38 
 
 
546 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  43.82 
 
 
546 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  43.82 
 
 
546 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  43.82 
 
 
546 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  28.96 
 
 
548 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  28.46 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  28.27 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  28.91 
 
 
546 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  26.58 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  50.5 
 
 
175 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.24 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
97 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 
97 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  58.82 
 
 
97 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  47.52 
 
 
139 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  52.22 
 
 
155 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  41.3 
 
 
137 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  45.3 
 
 
137 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  45.3 
 
 
137 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  44.55 
 
 
153 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
137 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
137 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
137 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
137 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  30.91 
 
 
226 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  38.97 
 
 
138 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  51.09 
 
 
156 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  44.25 
 
 
142 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  47.52 
 
 
147 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  51.09 
 
 
136 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
137 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  40.34 
 
 
153 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  45.37 
 
 
142 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  56.96 
 
 
190 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  45.69 
 
 
137 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  56.96 
 
 
180 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  59.49 
 
 
188 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.23 
 
 
175 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
155 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  56.96 
 
 
170 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  45.05 
 
 
174 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 
137 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  50 
 
 
135 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 
155 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
143 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  47.06 
 
 
139 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 
150 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 
150 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
162 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  42.99 
 
 
137 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  42.99 
 
 
137 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  46.67 
 
 
163 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 
154 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  42.99 
 
 
137 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  61.33 
 
 
99 aa  99.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  46.67 
 
 
162 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
162 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  42.99 
 
 
137 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  42.99 
 
 
137 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  53.66 
 
 
137 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
162 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
143 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
165 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
165 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 
138 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
161 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
159 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  51.14 
 
 
148 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
162 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 
138 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
162 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  46.53 
 
 
132 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>