More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1264 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  64.05 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  63.22 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  61.98 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.74 
 
 		 655 aa  296  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  52.74 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  56.83 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  53.45 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.67 
 
 		 251 aa  244  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  51.29 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51.49 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  53 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.72 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51.72 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.19 
 
 		 646 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.36 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.34 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.91 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  49.36 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.92 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51.54 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  51.32 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  55.17 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  51.72 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51.97 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.57 
 
 		 250 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.54 
 
 		 650 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.81 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50.22 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  49.12 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.41 
 
 		 654 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  49.58 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  46.26 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  54.15 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.38 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  53.77 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.29 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  46.38 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.93 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  53.52 
 
 		 254 aa  224  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.42 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.57 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.78 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.78 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  48.29 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  49.28 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  56.1 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50.7 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  53.1 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  47.68 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  49.37 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  47.16 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  47.16 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 265 aa  211  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  50.47 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  44.74 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  48.29 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  47.85 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.68 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44.54 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 246 aa  207  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  53.09 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.7 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  42.5 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>