222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1198 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  767    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.58 
 
 
394 aa  448  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  53.65 
 
 
396 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  57.74 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  51.7 
 
 
394 aa  411  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  48.3 
 
 
388 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  52.09 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  48.83 
 
 
395 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  51.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  44.79 
 
 
394 aa  352  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  42.19 
 
 
393 aa  339  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  40.77 
 
 
403 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
387 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
392 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 
387 aa  243  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  38.87 
 
 
399 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
396 aa  239  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
387 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 
387 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 
397 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.35 
 
 
397 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.15 
 
 
878 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 
404 aa  229  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  36.54 
 
 
399 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.88 
 
 
878 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
395 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 
395 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.43 
 
 
396 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  36.94 
 
 
395 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 
395 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 
396 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.68 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.44 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
387 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  32.15 
 
 
884 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 
402 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
407 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  32.14 
 
 
399 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.77 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  32.7 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.16 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  31.84 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
405 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  34.58 
 
 
423 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
400 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
421 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  32.59 
 
 
479 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
479 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.59 
 
 
479 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.16 
 
 
407 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.15 
 
 
405 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.31 
 
 
479 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 
394 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.31 
 
 
479 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.67 
 
 
431 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.03 
 
 
482 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.67 
 
 
505 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.31 
 
 
479 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 
400 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.51 
 
 
500 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  33.14 
 
 
410 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
407 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.13 
 
 
485 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.79 
 
 
498 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.79 
 
 
397 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.11 
 
 
494 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.69 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.21 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  35.28 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
401 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.85 
 
 
493 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  32.82 
 
 
402 aa  199  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  34.07 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.39 
 
 
503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.24 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  33.92 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  35.75 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.7 
 
 
504 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  30.26 
 
 
418 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.49 
 
 
400 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
402 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  33.52 
 
 
404 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
576 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
576 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>