19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1173 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1173  glutamate formiminotransferase  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0808  glutamate formiminotransferase  79.6 
 
 
303 aa  501  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0084  glutamate formiminotransferase  66.22 
 
 
304 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0084  glutamate formiminotransferase  66.22 
 
 
304 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0390  glutamate formiminotransferase  60.88 
 
 
298 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.767413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0241  glutamate formiminotransferase  62.59 
 
 
299 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.161753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0296  formiminotransferase, putative  57.29 
 
 
299 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0468401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0329  formiminotransferase-cyclodeaminase-related protein  52.88 
 
 
300 aa  349  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2818  glutamate formiminotransferase  49.16 
 
 
297 aa  322  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0915  glutamate formiminotransferase  48.33 
 
 
306 aa  315  6e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  50.68 
 
 
490 aa  309  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  47.97 
 
 
495 aa  302  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  44.11 
 
 
555 aa  269  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0528  glutamate formiminotransferase  40.46 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000113246  normal  0.11783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  39.86 
 
 
518 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1367  glutamate formimidoyltransferase  35.29 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0329  Formiminotransferase domain protein  33.11 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3011  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  33.61 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.509164  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88189  predicted protein  27.13 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0324672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>