108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1143 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  593  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  67.61 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  55.83 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  55.83 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  53.05 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  50.73 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 313 aa  248  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  48.74 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  44.89 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  42.05 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  43.1 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  42.96 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  41.52 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  41.79 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  39.85 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.76 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  38.79 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.35 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  41.18 
 
 		 373 aa  198  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.92 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  37.13 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 373 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 374 aa  142  5e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  30.48 
 
 		 345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.98 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 363 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  24.47 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 351 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.51 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.42 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.67 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 388 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.93 
 
 		 260 aa  45.8  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.14 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.81 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.09 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.93 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.29 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  23.98 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.43 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.27 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>