More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1134 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  801  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  78.2 
 
 
400 aa  637  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 
403 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2626  acetyl-CoA acetyltransferase  59.6 
 
 
402 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3533  acetyl-CoA acetyltransferase  54.8 
 
 
403 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  57.58 
 
 
394 aa  454  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0630  acetyl-CoA acetyltransferase  54.27 
 
 
401 aa  453  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05366  acetyl-CoA acetyltransferase  56.03 
 
 
403 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  54.77 
 
 
403 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 
390 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.87 
 
 
396 aa  438  1e-122  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.11 
 
 
396 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  54.04 
 
 
392 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  54.41 
 
 
392 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  54.16 
 
 
392 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  53.67 
 
 
392 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
391 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  53.77 
 
 
393 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.55 
 
 
390 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.04 
 
 
390 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  53.16 
 
 
392 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  54.55 
 
 
393 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  52.66 
 
 
392 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  54.8 
 
 
393 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  54.16 
 
 
393 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 
393 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
392 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
392 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 
390 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 
398 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
392 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  53.03 
 
 
390 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  52.9 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  53.03 
 
 
394 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  54.41 
 
 
393 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  54.27 
 
 
392 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
393 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  54.41 
 
 
392 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 
392 aa  417  1e-115  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
393 aa  418  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 
393 aa  416  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
393 aa  414  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
395 aa  416  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  416  1e-115  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  54.16 
 
 
392 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  416  1e-115  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  416  1e-115  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
393 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
394 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  53.27 
 
 
392 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
394 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  53.28 
 
 
391 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
393 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
394 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  53.15 
 
 
393 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  52.78 
 
 
391 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
392 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
392 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
388 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  54.02 
 
 
392 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 
391 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
408 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
393 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
393 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.02 
 
 
395 aa  406  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
393 aa  407  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
391 aa  407  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
402 aa  407  1e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  52.14 
 
 
395 aa  407  1e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
391 aa  405  1e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  52.9 
 
 
393 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
393 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.15 
 
 
392 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
391 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  52.02 
 
 
393 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  52.02 
 
 
393 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  52.14 
 
 
393 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
392 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
391 aa  398  1e-110  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 
392 aa  400  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  1.52049e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
396 aa  398  1e-110  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  52.14 
 
 
393 aa  401  1e-110  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>