111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1087 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 616 aa  1237    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.44 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  43.84 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  41.6 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.24 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  32.45 
 
 		 628 aa  296  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.22 
 
 		 613 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  35.06 
 
 		 276 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.27 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.49 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.59 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.44 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.58 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.79 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  21 
 
 		 626 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.08 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.2 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.27 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.5 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.95 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  36.57 
 
 		 150 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.98 
 
 		 639 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.28 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  26.2 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.28 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 		 652 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.26 
 
 		 607 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  23.89 
 
 		 586 aa  55.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.99 
 
 		 647 aa  54.7  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.96 
 
 		 642 aa  54.7  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.1 
 
 		 591 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  25.36 
 
 		 585 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  24.21 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  34.09 
 
 		 619 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  25.28 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  25.68 
 
 		 634 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  30 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  23.08 
 
 		 807 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.03 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  35 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  19.55 
 
 		 773 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.53 
 
 		 608 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  37.65 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.67 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  32.95 
 
 		 604 aa  51.2  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.53 
 
 		 382 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  24.4 
 
 		 661 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  33.04 
 
 		 728 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  27.6 
 
 		 685 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  25 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.86 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  26.98 
 
 		 976 aa  50.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  24.48 
 
 		 410 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  30.25 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  27.47 
 
 		 452 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.3 
 
 		 615 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  29.01 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.01 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  29.57 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0837  hypothetical protein  48.98 
 
 		 644 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  26.38 
 
 		 610 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  34.38 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.4 
 
 		 708 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.59 
 
 		 579 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.21 
 
 		 590 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  21.23 
 
 		 429 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  29.94 
 
 		 427 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 		 574 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  39.06 
 
 		 369 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.78 
 
 		 597 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  31.36 
 
 		 419 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  36.9 
 
 		 159 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.12 
 
 		 566 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  44.19 
 
 		 790 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  29.92 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  31.52 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  28.74 
 
 		 440 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.71 
 
 		 659 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  26.97 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.31 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.58 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  26.83 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.79 
 
 		 672 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  48.84 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.92 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  24.66 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  27.15 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  40.28 
 
 		 398 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  32.86 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.44 
 
 		 681 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  26.39 
 
 		 771 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  36.96 
 
 		 445 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.52 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  34.83 
 
 		 396 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  35 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  35.09 
 
 		 697 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  19.71 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  20.86 
 
 		 712 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>